Centre de données et services in-situ de la Station Biologique de Roscoff

CDS-IS-SBR

La Station Biologique de Roscoff (SBR) est un centre de recherche et d’enseignement supérieur en biologie et écologie marines. Elle est sous la double tutelle du CNRS et de Sorbonne Université (UPMC jusqu’en 2017).

Les équipes de recherche de la Station Biologique de Roscoff s’intéressent principalement à la biologie fondamentale et à l’étude de la biodiversité et des écosystèmes marins à différents niveaux d'intégration, du gène à l'écosystème. Ces recherches ont pour but de mieux comprendre l’évolution de la vie, ainsi que le fonctionnement des écosystèmes et l’adaptation des organismes marins face au changement global. Elles font appel aux méthodes les plus modernes de la biologie moléculaire et cellulaire, en particulier la génomique et ses corollaires, ainsi qu’aux interfaces avec les sciences de l’environnement, la chimie et les mathématiques.

La Station Biologique de Roscoff s’inscrit également dans une longue tradition de mission d’observation. Cette mission d’observation puise son origine à la création même de la Station avec le recensement des espèces marines animales et végétales de la région de Roscoff. Ces recensements aboutiront notamment à la publication des inventaires de la flore et de la faune, puis aux premières descriptions et cartographies des habitats marins. Les observations issues d’un plan d’échantillonnage à long terme, régulier et standardisé, en baie de Morlaix ont débuté dès les années 50 et se sont progressivement renforcées. Elles ont désormais pour objet l’acquisition des données nécessaires à la description et à l’analyse des interactions complexes entre processus physiques, chimiques et biologiques, régulant les cycles biogéochimiques, le fonctionnement des écosystèmes et la dynamique de la biodiversité en zone côtière en Manche occidentale.

La SBR est un acteur majeur de l’observation intervenant dans la production, la bancarisation et/ou la mise en accès de données issues de plusieurs réseaux ou services nationaux d'observation: SNO SOMLIT, SNO PHYTOBS, SNO COAST-HF, REBENT… 

Cela correspond à un effort cumulé de 1 400 jours par an, soit 7 équivalents temps plein à l’UMR 7144 et à la FR2424.

Dans le cadre du Pôle Océan ODATIS, le CDS-IS-SBR a la responsabilité de la base de données nationale RESOMAR-Pelagos. Cette base de données est le fruit d’un travail collaboratif du Réseau des Stations et Observatoires Marins (RESOMAR) regroupant des données de biodiversité de l’écosystème pélagique côtier (dont des séries temporelles). L’objectif majeur d’une telle base est d’exploiter l’information biologique acquise, pour répondre à des questions scientifiques (par exemple : l’étude des facteurs qui contrôlent la distribution et l’abondance des organismes pélagiques à différentes échelles spatiales et temporelles).

Cette liste ci-dessous classe les paramètres mesurés selon plusieurs niveaux : par projets, discipline et variables. Pour accéder directement aux jeux de données sur le catalogue ODATIS, cliquez directement sur les liens de cette liste.

Pour retrouver ces jeux de données dans le catalogue ODATIS, vous pouvez aussi baser votre recherche sur un ou plusieurs filtres de sélection: Centre de données: CDS-IS-Sorbonne Université > CDS-IS-SBR puis Variables et/ou utiliser le filtre de recherche textuelle (Rechercher : nom du projet par exemple).

PELAGOS

  • /Biologie marine : Phytoplancton, Zooplancton

SOMLIT

  • Mesures de basses fréquences :
    • /Physique de l'océan: température, salinité,
    • /Biologie marine: pico et nanoplancton, fluorescence, chlorophylle a, matière en suspension (MES),
    • /Biogéochimie marine: Alcalinité, Ammonium (NH4), Nitrates (NO3), Nitrites (NO2), Phosphates (PO4), Silicates (SiOH4), oxygène dissous, carbone organique particulaire (COP), Azote organique particulaire (NOP),  isotopes (delta15N, delta13C),
  • Profils de sonde CTD :
    • /Physique de l'océan: température, salinité, paramètres optiques (PAR)
    • /Biologie marine: fluorescence

COAST-HF

  • /Physique de l'océan: température, salinité,
  • /Biologie marine: fluorescence
  • /Biogéochimie marine: oxygène dissous, pression partielle CO2.
  • /Météorologie : température et pression atmosphériques, direction et vitesse du vent.

REBENT

  • Biologie marine : Habitats benthiques (Macrobenthos)

In-situ

Ferryboxes, bouées instrumentées, sondes SeaBird, cytométrie en flux, échantillonnage d’eau de mer (bouteille Niskin), échantillonnage au filet à plancton, échantillonnage à la benne Smith McIntyre.

PelagosLa base de données Pelagos est le fruit d’un travail collaboratif du Réseau des Stations et Observatoires Marins (RESOMAR). Elle regroupe des données de biodiversité de l’écosystème pélagique côtier (dont des séries temporelles). L’un des objectifs est d’exploiter l’information biologique acquise, pour répondre à des questions scientifiques concernant par exemple les facteurs qui contrôlent la distribution et l’abondance des organismes pélagiques à différentes échelles spatiales et à différentes échelles de temps.
PHYTOBSPHYTOBS a pour objectif de constituer un réseau national de dispositifs d'observation du microphytoplancton dont les principales caractéristiques sont des fréquences d'échantillonnages élevées et de nombreux paramètres mesurés dont l'estimation du phytoplancton total. Le réseau PHYTOBS associe les moyens et les compétences de l'Ifremer, du CNRS et des universités.
InventairesLes inventaires de la faune et la flore marine recensent les informations collectées, depuis plus de 130 ans, sur toutes les espèces récoltées ou capturées sur la côte nord de Bretagne comprise entre Portsal et les Sept Îles et sur les fonds compris dans un rayon de vingt-cinq milles autour de Roscoff. Pour chaque espèce sont données les références d'ouvrages permettant son identification et comportant diagnoses et figures, un résumé succinct de nos connaissances sur sa bionomie, la liste de ses stations les plus caractéristiques et, lorsque cela est connu, des indications relatives aux périodes de reproduction.

 

Publications scientifiques

  • Arsenieff L, Simon N, Rigaut-Jalabert F, Le Gall F, Chaffron S, Corre E, Com E, Bigeard E and Baudoux A-C. 2019. First Viruses Infecting the Marine Diatom Guinardia delicatula. Front. Microbiol. 9:3235. - doi.org/10.3389/fmicb.2018.03235
  • Baudoux A.-C., Lebredonchel H., Dehmer H., Latimier M., Edern R., Rigaut-Jalabert F., Ge P., Guillou L., Foulon E., Bozec Y., Cariou T., Desdevises Y., Derelle E., Grimsley N., Moreau H., Simon N., 2015. Interplay between, Micromonas cryptic species and their viruses in the Western English Channel. Environmental Microbiology Reports 7: 774:781
  • Bordeyne F., Davoult D., Migné A., Bertaud Du Chazaud E., Leroux C., Riera P., 2017. Trophic structure of two intertidal Fucus spp. Communities along a vertical gradient : Similarity and seasonal stability evidence with δ13C and δ15N. Journal of Sea Research, 120, 50-59. doi.org/10.1016/j.seares.2016.12.004
  • Goberville E, Beaugrand G, Sautour B, Tréguer P., 2010. Climate-driven changes in coastal marine systems of Western Europe. Marine Ecology Progress Series 408:129:147. doi: 10.3354/meps08564
  • Guilloux L., Rigaut-Jalabert F., Jouenne F., Ristori S., Viprey M., Not F., Vaulot, D & Simon, N. 2013. An annotated checklist of Marine Phytoplankton taxa at the SOMLIT : Astan time series off Roscoff (Western Channel, France) : data collected from 2000 to 2010. Cah.Biol.Mar. 54. (pdf)
  • Legrand E, Riera P, Lutier M, Coudret J, Grall J, Martin S, 2017. Species interactions can shift the response of a maerl bed community to ocean acidification and warming. Biogeosciences, 14, 5359-5376. (pdf)
  • Liénart, C. et al. 2017. Dynamics of particulate organic matter composition in coastal systems: A spatio-temporal study at multi-systems scale. Progress in Oceanography. 156, 221-239. https://doi.org/10.1016/j.pocean.2017.03.001
  • Rombouts, I., Simon, N., Aubert, A., Cariou, T., Feunteun, E., Guérin, L., McQuatters-Gollop, A., Hoebeke, M., Rigaut-Jalabert. F., Artigas, LF. 2019. Changes in marine phytoplankton diversity: assessment under the Marine Strategy Framework Directive. J. Ecological indicators. 102 : 265-277 https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.02.009
  • Salt, L.A., Beaumont, L., Blain, S., Bucciarelli, E., Grossteffan, E., Guillot, A., L’Helguen, S., Merlivat, L., Répécaud, M., Quéméner, L., Rimmelin-Maury, P., Tréguer, P., Bozec, Y., 2016. The annual and seasonal variability of the carbonate system in the Bay of Brest (Northwest Atlantic Shelf, 2008–2014), Marine Chemistry, 187: 1-15. doi:10.1016/j.marchem.2016.09.003.
  • Talarmin, A., Lomas M. W., Bozec Y., Savoye N., Frigstad H., Karl D. M., and Martiny A. C., 2016., Seasonal and long-term changes in elemental concentrations and ratios of marine particulate organic matter. Global Biogeochem. Cycles, 30, doi:10.1002/2016GB005409.
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